K-Ras Набір аналізу мутацій для ПЛР в реальному часі (екзон 2, 3 та 4)
50
KRAS-RT50
K-Ras/B-Raf Панель для аналізу мутацій для ПЛР в реальному часі (екзон 2, 3 та 4 KRAS та V600E BRAF)
50
KRBR-RT50
B-Raf V600E Набір для аналізу мутацій в ПЛР у реальному часі
50
BRAF-RT50
RAS c.59/117 Набір для визначення мутації*
50
RASX-RT50
* Для детекції KRAS c.59, NRAS c.59/117 соматичних мутацій. Доступний при замовленні NRAS-RT50, KRAS-RT50, або KRBR-RT50.
KRAS/BRAF Мутації та рак
Ген KRAS кодує малу GTPазу, що відіграє провідну роль в передачі сигналу від рецептору до епідермального ростового фактору (EGFR) до подальших ефекторів. KRAS мутації загалом виявляють у кількох типах пухлин лбюдини, таких як метастатичний колоректальний рак (mCRC), аденокарцинома легенів та рак щитовидної залози. Найчастіше мутації знаходять в кодонах 12, 13 та 61. Де-які дослідження демонстрували, що пухлини, які мали будь-яку з мутацій гену KRAS гірше відповідали на анти-EGFR антитільну терапію. Американська Асоціація Клінічної Онкології (ASCO) нещодавно випустина свій перший Provisional Clinical Opinion (PCO), що пропонує всіх пацієнтів, яким має бути призначена анти-EGFR моноклональна антитільна терапія (на приклад cetuximab, panitumumab або erlotnib) слід скринінгово обстежити на наявність KRAS мутацій. Окремі дослідження також показали, що не всі mCRC пацієнти з диким типом KRAS пухлин відповідають на анти-EGFR терапію. Це є підставою припустити, що додаткові гени та/або механізми можуть бути залучені до механізмів резистентності до цих препаратів. Мутації в BRAF, інший ланцюговий ефектор EGF-активованого патогенезу, було виявлено у 8% mCRC пухлин. Обстеження mCRC пацієнтів показали резистентність до анти-EGFR терапії у пацієнтів з пухлинами, що експресують мутований BRAF. Таким чином для окремих пацієнтів навіть було встановлено скорочення періоду непрогресії (PFS) та загального періоду виживання (OS) при лікуванні антагоністами EGFR. Ці дані є підставою наполегливо рекомендувати скринінг обох KRAS та BRAF мутацій, як необхідний захід для точного визначення пухлинних клітин, що не будуть відповідати на терапію анти-EGFR.
Цей набір визначає такі мутації в KRAS:
Екзон
Мутація
Зміна нуклеотиду
Зміна амінокислоти
COSMIC ID
2
G12D
c.35G>A
Гліцин (G) на Аспартат (D)
521
G12C
c.34G>T
Гліцин (G) на Цистеїн (C)
516
G12S
c.34G>A
Гліцин (G) на Серін (S)
517
G12R
c.34G>C
Гліцин (G) на Аргінін (R)
518
G12A
c.35G>C
Гліцин (G) на Аланін (A)
522
G12V
c.35G>T
Гліцин (G) на Валін (V)
520
G13D
c.38G>A
Гліцин (G) на Аспартат (D)
532
3
Q61H
c.183A>C & c.183A>T
Глутамін (Q) to Гістидін (H)
554 & 555
Q61L
c.182A>T
Глутамін (Q) на Леуцин (L)
553
Q61R
c.182A>G
Глутамін (Q) на Аргінін (R)
552
4
K117N
c.351A>C & c.351A>T
Лізин (K) на Аспарагін (N)
19940 & 28519
K117R
c.350A>G
Лізин (K) на Аргінін (R)
1178068
K117E
c.349A>G
Лізин (K) на Глутамат (E)
1360831
A146T
c.436G>A
Аланін (A) на Треонін (T)
19404
A146P
c.436G>C
Аланін (A) на Пролін (P)
19905
A146V
c.437C>T
Аланін (A) на Валін (V)
19900
Та BRAF:
Екзон
Мутація
Зміна нуклеотиду
Зміна амінокислоти
COSMIC ID
15
V600E
c.1799T>A
Валін (V) на Глутамат (E)
476
Для розширеного покриття, RAS c.59/117 Набір для визначення мутацій визначає KRAS c.59, NRAS c.59/117 соматичні мутації.
Процедура та аналіз
EntroGen KRAS/BRAF мутаційна панель це дослідження, що базується на ПЛР та використовує аллель-специфічні зонди для ідентифікації наявності мутацій в KRAS екзонах 2, 3 та 4, а також BRAF V600E. Процедура аналізу складається з 4 простих кроків:
Ізоляція ДНК з біопсії пухлини (фіксовані у формаліні, залиті у парафін зразки) або з свіжих заморожених зразків
Ампліфікація регіонів KRAS та BRAF генів з використанням аллель-специфічних зондів.
Визначення ампліфікованого продукту за допомогою ампліфікатора у реальному часі або з використанням гель-документації.
Документація та тлумачення тесту.
Тест може бути виконано лише за 2 години, починаючи від ізоляції ДНК до отримання результату.
Обладнання та матеріали
EntroGen KRAS/BRAF набір для визначення мутації потребує ПЛР ампліфікатора у реальному часі, налаштованого на детекцію FAM та VIC флуоресцентних зондів.
Набір включає реагенти, необхідні для ПЛР ампліфікації і детекції, а також контролі для валідації реакції. Колонки та реагенти для ізоляції ДНК до складу набору не входять.
Легалізація в Европі:
EntroGen KRAS/BRAF набір для визначення мутацій призначений для дослідницьких (RUO) та діагностичних (CE-IVD) цілей