KRAS та NRAS – це члени родини RAS GTPаз, що відіграють
центральну роль в патогенезі сигналів MAPK. Активація мутацій в екзоні
2 (кодон 12/13), екзоні 3 (кодон 59/61), та екзоні 4 (кодон 117/146)
спостерігається при різнит типах пухлин, включаючи метастатичний
коло-ректальний рак. Окремі клінічні дослідження з використанням
анти-EGFR таргетної терапії, показали, що пацієнти з пухлинами, в яких
було виявлено KRAS та NRAS мутації, гірше відповідають на таку терапію,
у порівнянні із пацієнтами, у яких такі мутації виявлено не було. (Clin
Cancer Res 2013;19:1902-1912).
Основні характеристики
Набір призначено для визначення RAS соматичних мутацій в
екзонах 2, 3, та 4 KRAS та NRAS генів. Далі приведено перелік
мутацій, що можна визначити за допомогою цього набору:
Ген
Мутація
Група
KRAS
G12A,
G12D, G12R, G12V, G13D
1
G12C,
G12S
2
Q61H,
Q61L, Q61R, A59E, A59G, A59T
3
K117N,
K117R, K117E
4
A146T,
A146P, A146V
5
NRAS
G12D,
G12C, G12S, G13R, G13V, K117R
6
Q61H,
Q61L, Q61K, Q61R
7
A59D,
A59T, A146T
8
Набір для визначення RAS мутацій
– це дослідження, основане на ПЛР
реакції з використанням аллель-специфічних зондів праймерів в
мультиплексній реакції для визначення наявності мутацій, загалом 8
реакцій для кожного зразку. Тест не дає можливості розрізняти мутації
всередині кожної групи.
Процедура та аналіз
EntroGen’s RAS набір
для аналізу мутацій для ПЛР дослідження
містить аллель-специфічні зонди для виявлення наявності RAS
мутації. Процедура аналізу включає три прості кроки:
Ізоляція ДНК з біопсії пухлини (фіксовані у формаліні, залиті у парафін
зразки) або з свіжих заморожених зразків
Ампліфікація регіонів RAS гену з використанням аллель-специфічних
зондів.
Визначення ампліфікованого
продукту за допомогою ампліфікатора у
реальному часі.
Тест може бути виконано лише за
2 години, починаючи від ізоляції ДНК до
отримання результату.
Обладнання та матеріали
EntroGen RAS набір для
визначення мутації потребує ПЛР ампліфікатора у
реальному часі, налаштованого на детекцію FAM та VIC флуоресцентних
зондів.
Набір включає реагенти,
необхідні для ПЛР ампліфікації і детекції, а
також контролі для валідації реакції. Колонки та реагенти для ізоляції
ДНК до складу набору не входять.
Легалізація в Европі:
EntroGen RAS набір для аналізу
мутацій призначений для
дослідницьких (RUO) та діагностичних (CE-IVD) цілей.