Хромосомні транслокації, що стосуються гену кінази анапластичної лімфоми (ALK) виявлено при різних видах раку, у тому числі 3-7% недрібноклітинного раку легенів (NSCLC). Ця структурна перебудова призводить до злиття ALK гену з іншими генами, наслідком чого є утворення хімеричного протеїну з онкогенним потенціалом. Таким чином розроблено інгібітори кінази, ціллю яких є кіназний домен ALK, які зараз і використовують для лікування ALK злиття-позитивних пацієнтів з недрібноклітинним раком легенів.
Переваги аналізу
Набір для виявлення злиття генів EML4-ALK містить реагенти для виявлення 9 EML4-ALK варіантів злиття генів, що притаманні раку легенів. Дослідження комбінує одноланцюговий cDNA синтез (зворотня транскрипція) і одночасну ампліфікацію мутантного ALK та референтні гени у єдиному кроці. Набір иявляє 7 варіантів (1, 2, 3a/b, 5a/b & 6) в єдиній реакції, однак не дає можливості відрізнити їх один від одного, і 2 варіанти (4 & 7) у другій реакції, але також без можливості відрізнити їх один від одного.
Цей набір розроблено для аналізу різних типів зразків, його можливо використовувати для виявлення мутацій в РНК, ізольованій з клітинних ліній, всіжих заморожених зразків, фіксованих у формаліні, залитих у парафін тканин.
Специфікації
Набір для виявлення злиття генів EML4-ALK дозволяє виявити такі мутації ALK:
варіант 1 (E13;A20)
варіант 2 (E20;A20)
варіант 3a (E6;A20)
варіант 3b (E6;insA20)
варіант 4 (E14;(-49)A20)
варіант 5a (E2;A20)
варіант 5b (E2;(+117)A20)
варіант 6 (E13;(+69)A20)
варіант 7 (E14;(-13)A20)
Обладнання та матеріали
Набір для виявлення злиття генів EML4-ALK потребує ампліфікатора ПЛР у реальному часі налаштованого на виявлення FAM та VIC флуоресцентних зондів. Цей набір включає суміш праймерів/зондів для детекції всіх 9 варіантів, однокроковий ферментний мікс для синтезу cDNA та ПЛР, а також валідовані контролі та стандарти. Колонки та реагенти для ізоляції РНК не включено.
США:
EntroGen PIK3CA набір для аналізу мутацій призначено тільки для дослідницьких цілей (RUO). Не використовувати для діагностичних процедур.
Європа:
EntroGen PIK3CA набір для аналізу мутацій наявний як у форматі «для дослідницьких цілей» (RUO) так і для діагностичних цілей (CE-IVD).
Огляд
1% ліміт детекції
Робота з FFPE, свіжими замороженими та тонкоголковими зразками
