B-Raf кодон 600 набір для аналізу мутацій для ПЛР у реальному часі (V600E/K/D)
64
BRAFM-RT64
B-Raf V600E/K/D/R/M набір для аналізу мутацій для ПЛР у реальному часі
64
BRAFX-RT64
BRAF мутації і рак
BRAF ген кодує серін/треонін протеїн кіназу, що відіграє роль в регуляції MAP кіназа/ERK сигнальному патологічному ланцюгу, що вражає ріст та проліферацію клітин. Соматичні мутації цього гену виявлено в пухлинах, у тому числі в неходжкінських лімфомах, колоректальному раку, злоякісній меланомі, папілярному раку щитовидної залози, недрібноклітинному раку легенів та легеневій аденокарциномі. Найбільш поширені мутації BRAF мають місце в кодоні 600, де амінокислотні заміни в активуючому сегменті кіназного домена створюють конструктивно активку форму протеїну. BRAF мутації зазвичай виявляють в пухлинах з диким типом K-Ras, N-Ras та EGFR.
Протокол тесту та аналіз
В таблиці нижче вказано мутації, що визначає цей набір та орієнтовно частоту їх виникнення в різних пухлинах.
Назва мутації
Заміна нуклеотиду
Заміна амінокислоти
Частота
V600E
c.1799T>A
Валін (V) на глутамат (E)
70-90%
V600K
c.1798_1799GT>AA
Валін (V) на лізин (K)
10-15%
V600D
c.1799_1800TG>AT
Валін (V) на аспартат (D)
<5%
V600R*
c.1798_1799GT>AG
Валін (V) на аргінін (R)
<5%
V600M*
c.1798G>A
Валін (V) на метіонін (M)
<1%
*Доступно лише в BRAFX-RT64 наборі.
Набір для аналізу мутацій BRAF в кодоні 600 від EntroGen - це дослідження на основі ПЛР з використанням алель-специфічних зондів для виявлення наявності BRAF V600E, V600K, та V600D мутацій (V600R та V600M включено в набір BRAFX-RT64). Процедура аналізу включає 3 простих кроки:
Ізоляцію ДНК з біопсій пухлини, зразків фіксованих у формаліні і залитих у парафін або свіжих заморожених тканини
Ампліфікацію регіонів BRAF гену з використанням аллель-специфічних зондів.
Детекцію продуктів ампліфікації на ампліфікаторі в реальному часі.
Цей тест може бути виконано лише за 2 відини, починаючи від ізоляції ДНК і закінчуючи результатом.
Обладнання та матеріали
BRAF кодон 600 набір для аналізу мутацій від EntroGen’s вимагає ПЛР ампліфікатора у реальному часі налаштованого на детекцію FAM та VIC флуоресцентних зондів.
До набору включено реагенти для ПЛР ампліфікації/детекції а також валідовані реакційні контролі. Колонки та реагенти для ізоляції ДНК не входять до складу набору.
Призначення
США:
EntroGen набір для аналізу мутацій призначено тільки для дослідницьких цілей (RUO). Не використовувати для діагностичних процедур.
Європа:
EntroGen набір для аналізу мутацій наявний як у форматі «для дослідницьких цілей» (RUO) так і для діагностичних цілей (CE-IVD).